[okfn-br] faltou software aberto? 15 anos de pesquisa em tomografia perdidos!?

Edgar Zanella Alvarenga e em vaz.io
Quinta Julho 7 16:42:03 UTC 2016


Não é o caso Peter. Os três sistemas analisados no artigo (SPM, FSL, 
AFNI)
são open source.

E.

On 07/07/2016 13:44, Peter Krauss wrote:
> Bom dia OKBRs,
> 
> Houve impacto na confiabilidade dos últimos 15 anos de pesquisa
> em Ressonância Magnética Funcional (do inglês fMRI [1] -
> _Functional magnetic resonance imaging_), e o tamanho deste impacto
> está sendo discutido por toda comunidade, usuária e de pesquisa, a
> partir deste artigo publicado em junho,
> 
>    http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1602413113 [2]
>    "Cluster failure: Why fMRI inferences for spatial extent have
> inflated false-positive rates"
>  
> 
> Não ficou claro o quanto de "software aberto" e "metodologia
> estatística aberta" vinham embarcados nos sistemas fMRI... Mas
> certamente o fato de serem todos empacotados em caixas pretas [3]
> (pacotes com _royalties _milionários da  Philips, Siemens, etc.), e
> de uma boa parte dos artigos  científicos (muitos indiretamente
> financiados pelas empresas) que "auditavam" o sistema não serem Open
> Access [4], ajudou a chegar neste extremo.
> 
> ALGUÉM TEM MAIS DADOS SOBRE ISSO?  
> Acredito que seja um _case_ importante de justificativa para ambos
> (!), o uso de software aberto e a necessidade de publicações
> científicas mais abertas e auditáveis.
> 
> - - - -
> PS: tem uma introdução didática sobre o assunto em portugues [5].
> 
> 
> 
> Links:
> ------
> [1] https://en.wikipedia.org/wiki/Functional_magnetic_resonance_imaging
> [2] http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1602413113
> [3] https://en.wikipedia.org/wiki/Black_box
> [4] https://en.wikipedia.org/wiki/Open_access
> [5]
> http://super.abril.com.br/ciencia/bug-em-software-de-ressonancia-magnetica-pode-invalidar-15-anos-de-pesquisas-sobre-o-cerebro
> 
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