[Open-science-nl] onderzoek/-wijs groepen met een GitHub account?

Sun Jan 22 07:56:57 UTC 2017

Hi Egon,

Mooi initiatief! Ik heb de Github van het Donders Instituut van de RU toegevoegd.

Groet,

Bram

On 22 Jan 2017, 08:40 +0100, open-science-nl-request at lists.okfn.org, wrote:
> Send Open-science-nl mailing list submissions to
> open-science-nl at lists.okfn.org
>
> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit
> https://lists.okfn.org/mailman/listinfo/open-science-nl
> or, via email, send a message with subject or body 'help' to
> open-science-nl-request at lists.okfn.org
>
> You can reach the person managing the list at
> open-science-nl-owner at lists.okfn.org
>
> When replying, please edit your Subject line so it is more specific
> than "Re: Contents of Open-science-nl digest..."
>
>
> Today's Topics:
>
> 1. onderzoek/-wijs groepen met een GitHub account? (Egon Willighagen)
> 2. Re: progress updat on Dutch National Open Science Plan
> (Egon Willighagen)
> 3. Re: onderzoek/-wijs groepen met een GitHub account?
> (Kramer, B.M.R. (Bianca))
>
>
> ----------------------------------------------------------------------
>
> Message: 1
> Date: Sat, 21 Jan 2017 15:17:46 +0100
> From: Egon Willighagen <egon.willighagen at gmail.com
> To: open-science-nl at lists.okfn.org
> Subject: [Open-science-nl] onderzoek/-wijs groepen met een GitHub
> account?
> Message-ID:
> <CAMPqvY_G2PW1HbZAzcd6pAhUs8D_CcY1_m1jhdbOuH6kmgB2bQ at mail.gmail.com
> Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
>
> Hoi allen, (en Jeroen, Bianca, zie onderaan...)
>
> om te laten zien dat het NL hogeronderwijs Open Science al omarmt, ben
> ik op zoek naar duidelijk meetbare dingen... je kan dan denken aan
> wetenschappers met een GitHub, BitBucket, of SourceForge account (voor
> open software) of een account op Figshare (voor open data) or op een
> preprint server... dat zijn er ongetwijfelt heel veel... Ook zou je
> kunnen kijken naar alle Open projecten waarbij NL groepen betrokken
> zijn... ook dat zullen er heel veel zijn.
>
> Dat zou heel wat crowdsourcing vereisen...
>
> Maar ik zat te denken aan een andere insteek, en daar heb ik gisteren
> even snel naar gekeken... welke onderzoeksgroepen hebben de moeite
> genomen om een GitHub organisatie op te zetten. Hypothese was dat
> naast onze BiGCaT afdeling er toch wel meer moesten zijn... en dat
> blijkt zo te zijn!
>
> Dit heeft ook crowdsourcing nodig, dus heb ik een Google Spreadsheet
> gemaakt met een seed, en in ieder geval een iemand heeft nog een groep
> toegevoegd!
>
> https://docs.google.com/spreadsheets/d/1yXNQg4S7GVRbaB__zCoBr67y_uwx7Eq-C4JGowJMAt0/edit#gid=0
>
> Op dit moment loopt Maastricht Uni voorop, gevolgd door de Radboud en
> Utrecht Unis. Hogescholen blijken wat moeilijker te vinden...
>
> Wie weet er meer?
>
> Jeroen, Bianca, ik denk dat jullie 101 innovations study alleen op
> persoonlijke info werkt, klopt?
>
> Egon
>
> --
> E.L. Willighagen
> Department of Bioinformatics - BiGCaT
> Maastricht University (http://www.bigcat.unimaas.nl/)
> Homepage: http://egonw.github.com/
> LinkedIn: http://se.linkedin.com/in/egonw
> Blog: http://chem-bla-ics.blogspot.com/
> PubList: http://www.citeulike.org/user/egonw/tag/papers
> ORCID: 0000-0001-7542-0286
> ImpactStory: https://impactstory.org/u/egonwillighagen
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 2
> Date: Sat, 21 Jan 2017 15:56:00 +0100
> From: Egon Willighagen <egon.willighagen at gmail.com
> To: "open-science-nl at lists.okfn.org" <open-science-nl at lists.okfn.org
> Subject: Re: [Open-science-nl] progress updat on Dutch National Open
> Science Plan
> Message-ID:
> <CAMPqvY-DU0BUMKum=fWBTrKqJmzzmfqA1kY1ao2JJsWdLuLJHw at mail.gmail.com
> Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
>
> Hi all,
>
> another update... one thing I did is looks for references on where the
> term "Open Science" comes from... so far, I can only trace it down to
> the Open Source and Open Data communities. I captured literature here:
>
> http://www.citeulike.org/group/20496
>
> Particularly, it seems quite influenced by Open Source and
> governmental researchers in the USA in the late 90-ties...
> particularly, the Brookhaven National Laboratory meeting was well
> covered by independent sources... it's nice to see the role that Dan
> Gezelter, operator of openscience.org, played in that, who was the
> first Dr. Who of the Jmol software... I visited Dan in 2000 when we
> designed the Chemistry Development Kit, which, yes, uses
> openscience.org as basis for the package names...
>
> On Wed, Jan 18, 2017 at 9:36 AM, Egon Willighagen
> <egon.willighagen at gmail.com> wrote:
> > It would be quite timely if we get our webpage reinstantiated and will
> > contact the OKFN Open Science coordinators about this.
>
> The science.okfn.org website seems a bit unstable, and I have trouble
> again accessing it... but I updated its Wiki to list the NL mailing
> list again...
>
> Other local groups have G+ parts and even separate websites... ideas welcome!
>
> Egon
>
> --
> E.L. Willighagen
> Department of Bioinformatics - BiGCaT
> Maastricht University (http://www.bigcat.unimaas.nl/)
> Homepage: http://egonw.github.com/
> LinkedIn: http://se.linkedin.com/in/egonw
> Blog: http://chem-bla-ics.blogspot.com/
> PubList: http://www.citeulike.org/user/egonw/tag/papers
> ORCID: 0000-0001-7542-0286
> ImpactStory: https://impactstory.org/u/egonwillighagen
>
>
> ------------------------------
>
> Message: 3
> Date: Sat, 21 Jan 2017 23:31:40 +0000
> From: "Kramer, B.M.R. (Bianca)" <B.M.R.Kramer at uu.nl
> To: Egon Willighagen <egon.willighagen at gmail.com>,
> "open-science-nl at lists.okfn.org" <open-science-nl at lists.okfn.org
> Subject: Re: [Open-science-nl] onderzoek/-wijs groepen met een GitHub
> account?
> Message-ID:
> <36F3D0F8AA4305469A1960786150CC5331468726 at WP0047.soliscom.uu.nl
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
>
> Ha Egon,
>
> Mooi idee om dat op het niveau van onderzoekgroepen te doen! Ik zal kijken of ik morgen wat tijd heb om te zien of ik info kan aanvullen.
>
> Met een andere insteek zijn Jeroen en ik enige tijd geleden op kleine schaal begonnen met het verzamelen van voorbeelden (ook in een workshop) van onderzoekers in NL die *een* aspect van hun workflow op een open manier uitvoeren. (zie bv. slide 20-27<https://docs.google.com/presentation/d/1FAQlSphvMbDLsG30PStqZ2iSHCsjgaJnb_jqlogzXW4/edit#slide=id.g190ef6129f_2_605> in een workshoppresentatie). Het idee hierbij is dus niet qua volume aantonen wat er al gebeurt in NL, maar voorbeelden te verzamelen die inspirerend kunnen zijn, vooral voor het idee dat je op heel veel manieren kunt beginnen met het opener maken van je onderzoeksworkflow.
>
> Wat je vraag over de survey betreft: data zijn op het niveau van (geanonimiseerde) individuele respondenten. Er is wel te filteren op land van huidige of laatste affiliatie (dus NL in dit geval), naast een aantal andere demographics (discipline, research role, year of 1st publication). Voor Utrecht hebben we daarnaast de eigen (eveneens geanonimiseerde) data, en dat geldt ook voor een aantal andere instellingen, maar het is aan henzelf wat men daarmee doet. Sowieso blijven het getalsmatige data, die niet terug te voeren zijn op onderzoeksgroepen, GitHub repos etc.
>
> Bijgaand de geaggregeerde resultaten voor Nederland (n=2041) voor een aantal onderzoeksactiviteiten gerelateerd aan Open Science. We hebben dit ook gedeeld met het NPOS schrijfteam.
>
> to be continued....
>
> groeten, Bianca
>
>
>
>
>
>
>
> 101 Innovations in Scholarly Communication
> .....................
> Bianca Kramer, PhD | Subject Specialist Life Sciences and Medicine | Utrecht University Library | Heidelberglaan 3 Utrecht NL-3584 CS | www.uu.nl/library | b.m.r.kramer at uu.nl | room G.01.503 UMC Utrecht | working hours Mon-Tue mornings, Thu-Fri all day | Twitter: @MsPhelps
>
> ________________________________________
> From: Egon Willighagen [egon.willighagen at gmail.com]
> Sent: Saturday, January 21, 2017 3:17 PM
> To: open-science-nl at lists.okfn.org
> Subject: onderzoek/-wijs groepen met een GitHub account?
>
> Hoi allen, (en Jeroen, Bianca, zie onderaan...)
>
> om te laten zien dat het NL hogeronderwijs Open Science al omarmt, ben
> ik op zoek naar duidelijk meetbare dingen... je kan dan denken aan
> wetenschappers met een GitHub, BitBucket, of SourceForge account (voor
> open software) of een account op Figshare (voor open data) or op een
> preprint server... dat zijn er ongetwijfelt heel veel... Ook zou je
> kunnen kijken naar alle Open projecten waarbij NL groepen betrokken
> zijn... ook dat zullen er heel veel zijn.
>
> Dat zou heel wat crowdsourcing vereisen...
>
> Maar ik zat te denken aan een andere insteek, en daar heb ik gisteren
> even snel naar gekeken... welke onderzoeksgroepen hebben de moeite
> genomen om een GitHub organisatie op te zetten. Hypothese was dat
> naast onze BiGCaT afdeling er toch wel meer moesten zijn... en dat
> blijkt zo te zijn!
>
> Dit heeft ook crowdsourcing nodig, dus heb ik een Google Spreadsheet
> gemaakt met een seed, en in ieder geval een iemand heeft nog een groep
> toegevoegd!
>
> https://docs.google.com/spreadsheets/d/1yXNQg4S7GVRbaB__zCoBr67y_uwx7Eq-C4JGowJMAt0/edit#gid=0
>
> Op dit moment loopt Maastricht Uni voorop, gevolgd door de Radboud en
> Utrecht Unis. Hogescholen blijken wat moeilijker te vinden...
>
> Wie weet er meer?
>
> Jeroen, Bianca, ik denk dat jullie 101 innovations study alleen op
> persoonlijke info werkt, klopt?
>
> Egon
>
> --
> E.L. Willighagen
> Department of Bioinformatics - BiGCaT
> Maastricht University (http://www.bigcat.unimaas.nl/)
> Homepage: http://egonw.github.com/
> LinkedIn: http://se.linkedin.com/in/egonw
> Blog: http://chem-bla-ics.blogspot.com/
> PubList: http://www.citeulike.org/user/egonw/tag/papers
> ORCID: 0000-0001-7542-0286
> ImpactStory: https://impactstory.org/u/egonwillighagen
> -------------- next part --------------
> An HTML attachment was scrubbed...
> URL: <http://lists.okfn.org/pipermail/open-science-nl/attachments/20170121/f4eb1911/attachment.html
> -------------- next part --------------
> A non-text attachment was scrubbed...
> Name: Open_Science_NL_activities_tools.pptx
> Type: application/vnd.openxmlformats-officedocument.presentationml.presentation
> Size: 7404542 (tel:7404542) bytes
> Desc: Open_Science_NL_activities_tools.pptx
> URL: <http://lists.okfn.org/pipermail/open-science-nl/attachments/20170121/f4eb1911/attachment.pptx
>
> ------------------------------
>
> Subject: Digest Footer
>
> _______________________________________________
> Open-science-nl mailing list
> Open-science-nl at lists.okfn.org
> https://lists.okfn.org/mailman/listinfo/open-science-nl
>
>
> ------------------------------
>
> End of Open-science-nl Digest, Vol 12, Issue 5
> **********************************************
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.okfn.org/pipermail/open-science-nl/attachments/20170122/bfde1cc7/attachment-0002.html>